Trái Đất đã đóng băng. Những người sống sót cuối cùng phải ở trên một con tàu khổng lồ chạy quanh thế giới, chật vật để cùng tồn tại trước sự cân bằng mong manh trên tàu.

Chuyến Tàu Băng Giá (Phần 3) kể về sáu tháng sau, Layton tiếp tục tìm kiếm nơi đủ điều kiện duy trì sự sống trên Trái Đất, còn Wilford vẫn sốt sắng truy lùng trong nỗi căm phẫn và khao khát trả thù.